Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms