Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Snx17Q8BVL3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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