Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms