Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms