Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms