Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Lrfn4Q80XU8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Lrfn4Q80XU8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Lrfn4Q80XU8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Lrfn4Q80XU8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Lrfn4Q80XU8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Lrfn4Q80XU8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Lrfn4Q80XU8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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Lrfn4Q80XU8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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