Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms