Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ell3Q80VR2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ell3Q80VR2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ell3Q80VR2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ell3Q80VR2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms