Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

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Length 1,164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo2Q7TSY8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms