Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

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Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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