Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Actn1Q7TPR4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Actn1Q7TPR4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Actn1Q7TPR4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Actn1Q7TPR4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Actn1Q7TPR4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms