Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shq1Q7TMX5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms