Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms