Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms