Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Mindy1Q76LS9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Mindy1Q76LS9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Mindy1Q76LS9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Mindy1Q76LS9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Mindy1Q76LS9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mindy1Q76LS9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms