Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nme8Q715T0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nme8Q715T0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nme8Q715T0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nme8Q715T0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nme8Q715T0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nme8Q715T0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nme8Q715T0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Nme8Q715T0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Nme8Q715T0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Nme8Q715T0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms