Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h4Q6ZPZ3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms