Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfrkbQ6PIJ4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms