Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tmeff1Q6PFE7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Tmeff1Q6PFE7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Tmeff1Q6PFE7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Tmeff1Q6PFE7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Tmeff1Q6PFE7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tmeff1Q6PFE7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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