Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trak1Q6PD31 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms