Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trim37Q6PCX9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trim37Q6PCX9 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trim37Q6PCX9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trim37Q6PCX9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trim37Q6PCX9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trim37Q6PCX9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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