Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttbk1Q6PCN3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttbk1Q6PCN3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttbk1Q6PCN3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttbk1Q6PCN3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttbk1Q6PCN3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Ttbk1Q6PCN3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Ttbk1Q6PCN3 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttbk1Q6PCN3 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttbk1Q6PCN3 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Ttbk1Q6PCN3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttbk1Q6PCN3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttbk1Q6PCN3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttbk1Q6PCN3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttbk1Q6PCN3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Ttbk1Q6PCN3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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Ttbk1Q6PCN3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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Ttbk1Q6PCN3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Ttbk1Q6PCN3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Ttbk1Q6PCN3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttbk1Q6PCN3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Ttbk1Q6PCN3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Ttbk1Q6PCN3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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Ttbk1Q6PCN3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttbk1Q6PCN3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttbk1Q6PCN3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttbk1Q6PCN3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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Ttbk1Q6PCN3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttbk1Q6PCN3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttbk1Q6PCN3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttbk1Q6PCN3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttbk1Q6PCN3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttbk1Q6PCN3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttbk1Q6PCN3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttbk1Q6PCN3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttbk1Q6PCN3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttbk1Q6PCN3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttbk1Q6PCN3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttbk1Q6PCN3 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttbk1Q6PCN3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttbk1Q6PCN3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttbk1Q6PCN3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttbk1Q6PCN3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttbk1Q6PCN3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms