Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp12Q6P5B0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp12Q6P5B0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp12Q6P5B0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp12Q6P5B0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rrp12Q6P5B0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rrp12Q6P5B0 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rrp12Q6P5B0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rrp12Q6P5B0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rrp12Q6P5B0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rrp12Q6P5B0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms