Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Tpm4Q6IRU2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Tpm4Q6IRU2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Tpm4Q6IRU2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Tpm4Q6IRU2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Tpm4Q6IRU2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Tpm4Q6IRU2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Tpm4Q6IRU2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Tpm4Q6IRU2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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