Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms