Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms