Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf280dQ68FE8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms