Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF6

Begain, Brain-enriched guanylate kinase-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BegainQ68EF6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BegainQ68EF6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms