Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms