Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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