Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema4aQ62178 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema4aQ62178 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms