Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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