Protein–RNA interactions for Protein: Q61846

Melk, Maternal embryonic leucine zipper kinase, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MelkQ61846 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MelkQ61846 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms