Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifna11Q61716 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna11Q61716 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms