Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxj1Q61660 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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