Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PcolceQ61398 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PcolceQ61398 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PcolceQ61398 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PcolceQ61398 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PcolceQ61398 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PcolceQ61398 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PcolceQ61398 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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PcolceQ61398 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms