Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mre11Q61216 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms