Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cln3Q61124 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cln3Q61124 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cln3Q61124 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cln3Q61124 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cln3Q61124 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cln3Q61124 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cln3Q61124 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cln3Q61124 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cln3Q61124 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cln3Q61124 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cln3Q61124 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cln3Q61124 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cln3Q61124 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cln3Q61124 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cln3Q61124 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms