Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms