Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms