Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms