Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc1Q60596 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc1Q60596 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc1Q60596 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc1Q60596 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc1Q60596 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms