Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms