Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tns3Q5SSZ5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms