Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim41Q5NCC3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms