Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.8 ms