Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms