Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms