Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc27Q3V036 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms