Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms